Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sf3b1Q99NB9 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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Sf3b1Q99NB9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Sf3b1Q99NB9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Sf3b1Q99NB9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Sf3b1Q99NB9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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