Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms