Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms