Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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