Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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