Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms