Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms