Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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