Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Smim11aQ99J19 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Smim11aQ99J19 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Smim11aQ99J19 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Smim11aQ99J19 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Smim11aQ99J19 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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