Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms