Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms