Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pde6cQ91ZQ1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms