Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NifkQ91VE6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NifkQ91VE6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NifkQ91VE6 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NifkQ91VE6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NifkQ91VE6 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NifkQ91VE6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NifkQ91VE6 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NifkQ91VE6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NifkQ91VE6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NifkQ91VE6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NifkQ91VE6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NifkQ91VE6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NifkQ91VE6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NifkQ91VE6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NifkQ91VE6 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NifkQ91VE6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NifkQ91VE6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms