Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 4930557J02Rik-201ENSMUST00000202325 1075 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms