Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

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Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Krt79Q8VED5 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Krt79Q8VED5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Krt79Q8VED5 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Krt79Q8VED5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Krt79Q8VED5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Krt79Q8VED5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Krt79Q8VED5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt79Q8VED5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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