Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms