Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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