Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC34

Rpap2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase Rpap2, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap2Q8VC34 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpap2Q8VC34 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms