Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms