Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms