Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Vmn1r200Q8R281 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Vmn1r200Q8R281 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Vmn1r200Q8R281 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Vmn1r200Q8R281 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Vmn1r200Q8R281 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Vmn1r200Q8R281 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Vmn1r200Q8R281 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Vmn1r200Q8R281 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Vmn1r200Q8R281 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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