Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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