Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casc3Q8K3W3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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