Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms