Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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