Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms