Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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