Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms