Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl11Q8CE33 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms