Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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