Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms