Protein–RNA interactions for Protein: Q8C166

Cpne1, Copine-1, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne1Q8C166 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne1Q8C166 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms