Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nek11Q8C0Q4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms