Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms