Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Pggt1bQ8BUY9 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Pggt1bQ8BUY9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Pggt1bQ8BUY9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Pggt1bQ8BUY9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Pggt1bQ8BUY9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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