Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms