Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHD4

Frmd3, FERM domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd3Q8BHD4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Frmd3Q8BHD4 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmd3Q8BHD4 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms