Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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