Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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