Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms