Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem39bQ810L4 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem39bQ810L4 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem39bQ810L4 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem39bQ810L4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem39bQ810L4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem39bQ810L4 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem39bQ810L4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem39bQ810L4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem39bQ810L4 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem39bQ810L4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem39bQ810L4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem39bQ810L4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem39bQ810L4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem39bQ810L4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem39bQ810L4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem39bQ810L4 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem39bQ810L4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem39bQ810L4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem39bQ810L4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem39bQ810L4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem39bQ810L4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem39bQ810L4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem39bQ810L4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms