Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Amigo1Q80ZD8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Amigo1Q80ZD8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
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Amigo1Q80ZD8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Amigo1Q80ZD8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Amigo1Q80ZD8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Amigo1Q80ZD8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Amigo1Q80ZD8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Amigo1Q80ZD8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Amigo1Q80ZD8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Amigo1Q80ZD8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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