Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR3

Skida1, SKI/DACH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skida1Q80YR3 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Gm11389-201ENSMUST00000121407 430 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 4933430M04Rik-201ENSMUST00000152726 744 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Nup37-202ENSMUST00000169309 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Gm24925-201ENSMUST00000178157 107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Gm27033-201ENSMUST00000183226 544 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Oosp1-203ENSMUST00000186557 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Gm18800-201ENSMUST00000186588 637 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Gm44395-201ENSMUST00000197056 153 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Olfr892-ps1-201ENSMUST00000211998 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skida1Q80YR3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 Tpt1-ps2-201ENSMUST00000120548 521 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 Gm43664-201ENSMUST00000196038 734 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 Gm44176-201ENSMUST00000204336 276 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 Gm44889-201ENSMUST00000207674 1019 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 AC166902.3-201ENSMUST00000216696 991 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 Gm3213-201ENSMUST00000219296 441 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 Gm7119-201ENSMUST00000221345 695 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skida1Q80YR3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms