Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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Ttc28Q80XJ3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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Ttc28Q80XJ3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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Ttc28Q80XJ3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ttc28Q80XJ3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms