Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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Zbed4Q80WQ9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Zbed4Q80WQ9 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms