Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc29Q80VM3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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