Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms