Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms