Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sys1Q78S06 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms