Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubfd1Q78JW9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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